Напомним, что без вести пропавшую девочку искали 11 дней. 9 июня она гуляла в районе парка «Металлург» в городе Братске. Около 20 часов 30 минут девочка заходила в магазин «Облака» по улице Баркова, где работала ее мать. Это последнее видео, на котором Алина, счастливая и улыбающаяся, играет с букетом цветов. Выйдя из магазина, девочка направилась в сторону своего дома, но там она так и не появилась. Сотрудники Следственного комитета, полиции, Росгвардии и волонтеры провели около тысячи подворовых обходов, проверили более 300 колодцев, нежилых заброшенных зданий, подвалов, допросили более 500 человек. На причастность к происшествию отрабатывались водители, которые проезжали в данном районе. При поддержке администрации Братска были напечатаны и расклеены на остановках и в общественных местах листовки. Активно проверяли ранее судимых лиц, состоящих на учете: было проверено не менее 200 человек.
В результате огромной розыскной работы через 11 дней следователи и сотрудники уголовного розыска задержали 43-летнего жителя города Братска. Установить личность подозреваемого в убийстве Алины Шакировой помог анализ материалов с камер видеонаблюдения, собранных во время поисков девочки. Мужчина, имя которого пока не называется, дал признательные показания и указал место сокрытия тела девочки за городской чертой. Труп со следами насильственной смерти был обнаружен в указанном им месте.
О предполагаемом убийце пока известно немного. По предварительным данным, он работал в такси, раньше привлекался к ответственности за совершение преступления. Ему было предъявлено обвинение в совершении тяжкого преступления, предусмотренного п. «в» ч. 2 ст. 105 УК РФ (убийство малолетней), по уголовному делу, возбужденному по факту безвестного исчезновения 9-летней Алины Шакировой. Причиной смерти ребенка стала механическая асфиксия от сдавления шеи (удушение).
25 июня сотни людей пришли к школе N9, где училась Алина, чтобы проститься с ней. Старшеклассники выстроились в живой коридор, через который прошла траурная процессия. Пришли и те, кто знал девочку, и те, кто помогал ее искать. Для Алины в стенах родной школы прозвучал последний звонок.